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研究発表

  • Ichinose, M., Teramoto, T., Nakamura, I. et al. Fine-tuning of the PPR protein directs the RNA editing activity toward C-to-U or U-to-C conversion. Sci Rep 15, 6288 (2025).
  • Ping, N., Hara-Kuge, S., Yagi, Y. et al. Translational enhancement of target endogenous mRNA in mammalian cells using programmable RNA-binding pentatricopeptide repeat proteins. Sci Rep 14, 251 (2024).
  • Yusuke Yagi, Takamasa Teramoto, Shuji Kaieda, Takayoshi Imai, Tadamasa Sasaki, Maiko Yagi, Nana Maekawa and Takahiro Nakamura Construction of A Versatile, Programmable RNA-binding Protein using Designer PPR Proteins and Its Application for Splicing Control in Mammalian Cells 2022, 11(22), 3529.
  • Ichinose M., Kawabata M., Akaiwa Y., Shimajiri Y., Nakamura I., Tamai T., Nakamura T., Yagi Y. and Gutmann B.U-to-C RNA editing by synthetic PPR-DYW proteins in bacteria and human culture cells Commun Biol 5, 968 (2022).
  • Imai, T., Yagi, Y., Nakamura, T. (2018). Recent Progress Toward RNA Manipulation with Engineered Pentatricopeptide Repeat Proteins. In: Masuda, S., Izawa, S. (eds) Applied RNA Bioscience. Springer, Singapore.
  • Yagi Y, Shirakawa M, Nakamura T. The challenges faced by EditForce Inc., to go beyond genome editing. Nature 528 suppl (2015).
  • Okuda K, Shoki H, Arai M, Shikanai T, Small I, Nakamura T. Quantitative analysis of motifs contributing to the interaction between PLS-subfamily members and their target RNA sequences in plastid RNA editing. Plant J 80, 870-882 (2014).
  • Yagi Y, Nakamura T, Small I. The potential for manipulating RNA with pentatricopeptide repeat proteins. Plant J 78, 772-782 (2014).
  • Yagi Y, Tachikawa M, Noguchi H, Satoh S, Obokata J, Nakamura T. Pentatricopeptide repeat proteins involved in plant organellar RNA editing. RNA Biol 10, 1419-1425 (2013).
  • Yagi Y, Hayashi S, Kobayashi K, Hirayama T, Nakamura T. Elucidation of the RNA recognition code for pentatricopeptide repeat proteins involved in organelle RNA editing in plants. PLoS ONE 8, e57286 (2013).
  • Nakamura T, Yagi Y, Kobayashi K. Mechanistic insight into pentatricopeptide repeat proteins as sequence-specific RNA-binding proteins for organellar RNAs in plants. Plant Cell Physiol 53, 1171-1179 (2012).
  • Kobayashi K, Kawabata M, Hisano K, Kazama T, Matsuoka K, Sugita M, Nakamura T. Identification and characterization of the RNA binding surface of the pentatricopeptide repeat protein. Nucleic Acids Res 40, 2712-2723 (2012).
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